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為儲備充足且有準備的勞動力以促使我國工業升級，於民國70年11月1日先成立南區職業訓練中心籌備處，民國74年4月1日在臺南縣官田鄉官田工業區內正式成立「臺灣省南區職業訓練中心」，隸屬臺灣省政府。之後臺灣省政府勞工處成立，民國77年1月15日起改隸臺灣省政府勞工處，並更名為「臺灣省政府勞工處南區職業訓練中心」。民國88年7月1日臺灣省政府功能業務與組織調整，南區職訓中心配合改隸於行政院勞工委員會職業訓練局，並更名為「行政院勞工委員會職業訓練局臺南職業訓練中心」。 行政院勞工委員會職業訓練局雲嘉南區就業服務中心始於民國55年成立，原機關名稱為「臺灣省台南區國民就業輔導中心」隸屬於臺灣省政府社會處，並先後於雲林縣、嘉義縣市、臺南縣市轄區內成立斗六、北港、嘉義、朴子、新營等就業服務站。 民國76年11月7日臺灣省政府勞工處成立，77年1月改隸勞工處，83年7月配合組織規程修正更名為「臺灣省政府勞工處台南區就業服務中心」，並以協助民眾求職、雇主求才為主要職掌業務，並自88年1月起開始受理勞工保險失業給付認定業務。 民國88年7月1日臺灣省政府功能業務與組織調整，雲嘉南就服中心同時配合改隸於行政院勞工委員會職業訓練局，更名為「行政院勞工委員會職業訓練局台南區就業服務中心」。92年新設永康就業服務站，增加原臺南縣曾文溪以南近都會區民眾求職之便利性，嘉義、北港、斗六、新營等就業服務站亦分別租用新辦公廳舍擴大服務場域，一改以往擁擠窘況，93年3月1日台南就業服務站成立，轄區內7個就業服務站架構于焉成形。又為回應地方民意需求使與機關名稱能涵蓋其服務區域，94年6月21日正式更名為「行政院勞工委員會職業訓練局雲嘉南區就業服務中心」。 為使組織更為精簡、有彈性、高效能，並促進勞動力的運用、提升與開發，強化國家競爭力，並因應勞動情勢變化，增進國民就業安全，及深化就業促進功能，爰配合國家政府組織改造作業，整合臺南職業訓練中心及雲嘉南區就業服務中心兩大行政機關為「勞動力發展署雲嘉南分署」，為確保合併改制前後之業務順利銜接，無縫接軌營運，兩中心於101年3月5日起即試行整併營運，雲嘉南區就業服務中心搬遷至官田，直至103年1月9日經立法院審議通過，103年2月17日正式改制為「勞動部勞動力發展署雲嘉南分署」運作，103年3月4日揭牌，持續整合就業服務、職業訓練、技能檢定、創業服務等多元資源，共同促進雲嘉南區之勞動力發展。